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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

国内最大直径单管双层盾构隧道在武汉贯通******

　　中新网武汉2月1日电 (刘福昌 杨路)随着“和平号”盾构机的顺利接收，武汉和平大道南延工程隧道2月1日上午9时许贯通，这也是目前国内最大直径单管双层盾构隧道。

　　和平大道南延工程位于武汉市武昌区，全长3042米，规划为城市主干路，北接和平大道、南连武金堤路，是武昌顺江方向的骨干通道。据武汉城建集团项目负责人袁亮介绍，工程计划2023年底建成通车，将有效改善武昌古城交通出行条件、缓解中山路—白沙洲大道交通压力。

　　此次贯通的隧道，为单管双层双向六车道，设计速度为每小时50公里。2021年8月29日，一台开挖直径达16.03米的盾构机，由中山路“武胜门”遗址区域始发掘进，至黄鹤楼南路接收，隧道下穿武昌古城、蛇山，地质条件复杂，距运营地铁5号线隧道水平距离仅有10米，是国内施工技术含量和难度较高的隧道之一。

　　据介绍，为确保盾构机顺利完成掘进，项目不仅成立盾构技术专家组，对盾构机选型设计及施工难题进行指导把关，还在掘进过程中，应用自动化监测施工技术，对沿线敏感建构筑物布设观测点，实时监测沉降数据，同步调整掘进参数，实现了安全平稳穿越。

　　中铁十四局项目负责人张建勇表示，该隧道的贯通为打通城市断头路，保护古城遗迹和风景名胜、开发利用地下空间提供了成功案例。(完)

　　（文图：赵筱尘 巫邓炎）